pacman'i birden fazla uygulama kullanınca böyle olur genelde. Paket yöneticisi çalışırken uçbirimden de pacman ile yükleme ya da güncelleme yapmak istemiş olabilirsiniz.

Öncelikle veritabanı halen kilitli ise kilidi kaldıralım, uçbirimden:

sudo rm /var/lib/pacman/db.lck

bu komut her ne çıktı verirse versin, işlem tamamdır.

sonrasında yine uçbirimden:

sudo pacman -Syyu