Öncelikle oluşan hatayı çıktı olarak paylaşırsanız daha faydalı olur.

# pacman -Syy
# pacman -Syu

bende bu hatayı veriyor

[root@frkn selatinabi]# pacman -Syy
:: Paket veritabanları senkronize ediliyor...
 core                     120,7 KiB   343K/s 00:00 [######################] 100%
 extra                   1659,2 KiB   338K/s 00:05 [######################] 100%
 community                  2,2 MiB   205K/s 00:11 [######################] 100%
hata: Couldn't open file /home/custompkgs/custom.db hatası nedeniyle 'custom.db' dosyası disk adresinden alınamadı
hata: custom (indirme kütüphanesi hatası) güncellenemedi


[root@frkn selatinabi]# pacman -Syu
:: Paket veritabanları senkronize ediliyor...
 core deposu güncel
 extra deposu güncel
 community deposu güncel
hata: Couldn't open file /home/custompkgs/custom.db hatası nedeniyle 'custom.db' dosyası disk adresinden alınamadı
hata: custom (indirme kütüphanesi hatası) güncellenemedi
:: Sistem güncellemesi başlatılıyor...
uyarı: blueman: yerel depodaki paket (20131021git-2) community deposundaki paketten (1.2.3.20140421.3f44bf5-1) daha güncel
uyarı: python-configobj: yerel depodaki paket (20130328-1) community deposundaki paketten (5.0.3-1) daha güncel
 yapılacak bir şey yok
[root@frkn selatinabi]# 

Maalesef hata devam ediyor

/etc/pacman.conf dosya içerigini buraya aktarabilirmisin?

Maalesef hata devam ediyor

sudo rm -r /home/custompkgs/custom.db
sudo rm -r /home/$USER/custompkgs/custom.db
sudo pacman -S manjaro-system --force
sudo pacman -Syyu

ile güncelleyin, sorun çıkarsa çıktıyı paylaşın buradan.

Komut ile pacman.conf dosyasını açalım ve tümünü seçip silelim

sudo gedit /etc/pacman.conf

Yerine aşagıdaki içeriği seçip yapıştıralım ve kaydedelim

#
# /etc/pacman.conf
#
# See the pacman.conf(5) manpage for option and repository directives

#
# GENERAL OPTIONS
#
[options]
# The following paths are commented out with their default values listed.
# If you wish to use different paths, uncomment and update the paths.
#RootDir = /
#DBPath = /var/lib/pacman/
#CacheDir = /var/cache/pacman/pkg/
#LogFile = /var/log/pacman.log
#GPGDir = /etc/pacman.d/gnupg/
HoldPkg = pacman glibc manjaro-system
# If upgrades are available for these packages they will be asked for first
SyncFirst = manjaro-system pacman
#XferCommand = /usr/bin/curl -C - -f %u > %o
#XferCommand = /usr/bin/wget --passive-ftp -c -O %o %u
#CleanMethod = KeepInstalled
#UseDelta = 0.7
Architecture = auto


# Pacman won't upgrade packages listed in IgnorePkg and members of IgnoreGroup
#IgnorePkg =
#IgnoreGroup =


#NoUpgrade =
#NoExtract =


# Misc options
#UseSyslog
#Color
#TotalDownload
CheckSpace
#VerbosePkgLists


# By default, pacman accepts packages signed by keys that its local keyring
# trusts (see pacman-key and its man page), as well as unsigned packages.
SigLevel = Required DatabaseOptional
LocalFileSigLevel = Optional
#RemoteFileSigLevel = Required


# NOTE: You must run `pacman-key --init` before first using pacman; the local
# keyring can then be populated with the keys of all official Arch Linux
# packagers with `pacman-key --populate archlinux`.


#
# REPOSITORIES
# - can be defined here or included from another file
# - pacman will search repositories in the order defined here
# - local/custom mirrors can be added here or in separate files
# - repositories listed first will take precedence when packages
# have identical names, regardless of version number
# - URLs will have $repo replaced by the name of the current repo
# - URLs will have $arch replaced by the name of the architecture
#
# Repository entries are of the format:
# [repo-name]
# Server = ServerName
# Include = IncludePath
#
# The header [repo-name] is crucial - it must be present and
# uncommented to enable the repo.
#

[core]
Include = /etc/pacman.d/mirrorlist

[extra]
Include = /etc/pacman.d/mirrorlist

[community]
Include = /etc/pacman.d/mirrorlist

# An example of a custom package repository. See the pacman manpage for
# tips on creating your own repositories.
#[custom]
SigLevel = Never
#Server = file:///home/custompkgs

Araştırma yaparken, "Cumali"nin buradaki http://archtr.org/forum/viewtopic.php?f=66&t=57&start=150 yazısını buldum ve pacman.conf dosyasını değiştirdim.
Güncellemeler ve program kurma işlemleri normale döndü.

Cumali ve Tulliana kardeşlerime yardımları için çok teşekkür ediyorum.
Sizin sayenizde Manjaro-kolik oldum 🙂